As doenças mais comuns que preocupam os piscicultores são causadas pelas práticas de manejo inapropriadas que acontecem no sistema de cultivo intensivo, principalmente quando o assunto é alimentação e limpeza dos viveiros. Muitos dos descuidos que causam doenças no cultivo de peixes poderiam ser evitados. Nesta lista está incluído doenças causadas por nutrição, falta de oxigênio e queda de temperatura. 

O metabolismo e a fisiologia dos peixes são afetados pelas condições ambientais, então é necessário que se tenha mais cuidado, principalmente no inverno, quando há uma grande variação de temperatura. Em Mato Grosso, estes cuidados devem ser tomados quando as temperaturas ficam mais amenas e o metabolismo dos peixes diminui. Isso faz com que eles se alimentem menos e, por isso, é importante que se tenha uma alimentação balanceada.

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